Der Meister und Margarita ist ein satirischer Fantasy-Roman, der von seiner Frau sechsundzwanzig Jahre nach seinem Tod 1966 veröffentlicht wurde und ihm kritische Unsterblichkeit verliehen hat. Das Buch war in der Sowjetunion viele Jahre lang im Untergrund als Samisdat ("sam "+ "izdat" - "selbst veröffentlicht", Wladimir Bukowski definierte es als "ich selbst schaffe es, bearbeite es, zensiere es, veröffentliche es, verbreite es und [kann] dafür ins Gefängnis kommen") erhältlich, bevor eine zensierte Fassung in der Zeitschrift Moskwa veröffentlicht wurde. Ein zerstörtes Manuskript des Meisters ist ein wichtiges Element der Handlung, und tatsächlich musste Bulgakow den Roman aus dem Gedächtnis neu schreiben, nachdem er den Entwurf des Manuskripts eigenhändig verbrannt hatte.
Der Roman ist eine vielschichtige Kritik an der sowjetischen Gesellschaft im Allgemeinen und an ihrem literarischen Establishment im Besonderen. Er beginnt damit, dass Satan in den 1920er oder 30er Jahren Moskau besucht und sich in ein Gespräch zwischen einem Kritiker und einem Dichter einschaltet, die eifrig über die Existenz von Jesus Christus und dem Teufel diskutieren.
Dann entwickelt er sich zu einer umfassenden Anklage gegen Korruption, Gier, Engstirnigkeit und die weit verbreitete Paranoia in Sowjetrussland. Der verbotene, aber viel gelesene Roman sicherte Bulgakow einen festen Platz im Pantheon der großen russischen Schriftsteller.