De Nameless Invaders transformeren de planeet Aarde in een levensvatbaar ecosysteem voor hen. Commandant Tarik Connar wordt door een ondoordachte 'verre stap' in een alternatieve realiteit gestort. Hij maakt de komst van de buitenaardse wezens aan den lijve mee en weet maar net aan ze te ontsnappen. Plotseling bevindt hij zich in een gevecht op leven en dood. Samen met de laatste vier gemuteerde overlevenden van de apocalyps weet hij zich ongemerkt aan boord van een van de buitenaardse schepen te smokkelen.
In een verzegelde energiekamer, diep onder de grond verborgen in het Chron-Bastion EreSkigal, liggen twee ooit kunstmatig gecreëerde levensvormen in een slaap-achtige stase, Liam, een levensvorm gecreëerd uit een 'Second Life' spel en Hyp, het materiële hologram (Avatar) van Future I, dat ooit een eigen bewustzijn had ontwikkeld. Het waren levensvormen die waren geëvolueerd uit een soort verzachte, donkere energie.